小农经济以家庭为单位的碎片化生产，导致农业技术推广成本高难题。土地细碎化使得大型农机具难以普及，测土配方施肥、病虫害统防统治等规模化技术应用受限。

杂交玉米在印度推广30年普及率仅6.8%，而中国在基层农技体系健全时期仅用5年完成普及，分散经营下技术转化效率低下问题不可忽视。

个体农户面对新技术的风险承受能力弱，“增产不增收”的现实困境导致创新动力不足，形成“技术停滞-效益低下”的恶性循环。

单家独户的市场议价能力薄弱，陷入“高进低出”的交易劣势。农资采购依赖中间商层层加价，农产品销售受市场波动冲击显著，价格过山车现象频发，农民利润被严重挤压。

2025年数据显示，小农经营下农产品流通成本占售价的30%-40%，而规模化经营可压缩至15%以下。

信息不对称与物流不经济，使农户在产业链中沦为价值分配的最末端，难以分享市场增值收益，造成了“农产品便宜农民不赚钱，农产品价格高涨跟农民关系不大”的问题。

水利、交通等农村基础设施具有显著的公共属性，与小农分散经营存在天然矛盾。

1980年后我国灌溉面积增速放缓，“最后一公里”管护难题凸显，不少地区机井利用率从1970年代开始就在降低。

即使政府加大“五小水利”投入，权责不清导致的“人人有责却人人无责”局面，使设施完好率不足，严重制约农业抗灾能力与生产效率提升。

小农经济无法消化过剩劳动力，导致“过密化”发展陷阱。江南地区历史上家庭手工业的繁荣并未提升人均收入，反而因劳动时间无限延长陷入边际效益递减。

当前农村青壮劳动力大规模进城，留下的“386199部队”（妇女、儿童、老人）难以承担现代农业发展任务，土地撂荒率在许多地区增长。

这种“被动城市化”不仅加剧城市公共服务压力，更造成农村人才断层与产业空心化。